Quyết tâm loại bỏ mẹ con Dung của “Hoạn Thư” Ngọc Khuê càng lúc càng cao. Vô tình cấu kết hại chết bà Ngà, Văn Tài và Ngọc Khuê bớt thêm được một vật cản đường. Mẹ đột ngột ra đi là mất mát lớn, khiến trụ cột gia đình luôn mạnh mẽ như ông Đạt cũng phải gục ngã.

Trong diễn biến tiếp theo, sự xuất hiện của đứa con riêng Hữu Nguyện đã làm mọi thứ bị đảo lộn. Chẳng được hoan nghênh, cậu bé vẫn dần dần thích nghi cuộc sống mới giữa bủa vây âm mưu, toan tính tại nhà họ Trần. Bị phát hiện đến khu vực cấm nhưng tình thế của Nguyện xoay chuyển bất ngờ.

Một thân một mình cô đơn ở lại nhà cha ruột không có mẹ bên cạnh, Hữu Nguyện sống từng ngày quả chẳng dễ dàng. Sau khi trải qua những khó khăn, có lẽ cậu bé sẽ học được cách tồn tại ở nhà họ Trần và trưởng thành hơn trong suy nghĩ.

Không còn cách nào khác để bảo vệ an toàn mãi mãi và cũng vì tương lai của con trai, Dung liều lĩnh gửi Hữu Nguyện lại nhà họ Trần. Chưa hề đòi hỏi quyền lợi cho bản thân chịu thiệt thòi suốt nhiều năm, thế nhưng sự xuất hiện trở lại của Dung khiến Ngọc Khuê và Văn Tài căm tức tột cùng.

Dù bị Văn Tài và Ngọc Khuê tìm cách tiêu diệt, cản trở thì Thành Đạt và con trai Dung vẫn có thể gặp nhau nhiều lần. Trải qua nhiều biến cố và muốn để con có thể trưởng thành trong môi trường tốt nhất, Dung thay đổi quyết định bất ngờ.

Cứ ngỡ cuộc sống bình yên sẽ tiếp diễn mãi sau khi trốn thoát nhưng mẹ con Dung lại trớ trêu có đụng độ liên quan đến xưởng bánh của Thành Đạt. Không hề muốn tranh đấu nhưng vì có đứa con ngoài giá thú, Dung sớm muộn cũng bị cuốn vào nguy hiểm một lần nữa. Trong khi đó, Ngọc Khuê mặc sức ngày càng cưng chiều Gia Bảo hơn cưng trứng.

Sóng gió ập đến liên tiếp với gia đình của Thành Đạt. Việc Dung có thai với Thành Đạt khiến mạng sống của cô và đứa con trong bụng gặp nguy hiểm hơn bao giờ hết. Vì Ngọc Khuê và Văn Tài sẽ khó mà tha cho Dung. Để bảo toàn địa vị và tham vọng của mình, Ngọc Khuê “tiến một bước” cùng Văn Tài.

Tiếp nối thành công vang dội của Vua bánh mì bản Hàn, kịch bản Vua bánh mì bản Việt được làm lại từ bản gốc nhưng không chạy theo toàn bộ. Tuy cốt truyện Hàn nhưng mang đậm tinh thần Việt. Phim lấy chủ đề chính xoay quanh tình cảm gia đình, mâu thuẫn thế hệ trước kéo dài liên đới gây bi kịch cho thế hệ sau.